The Lancet Microbe dergisinde Mayıs 2023’te yayımlanan bu izlem çalışmasında daha önce topluluk düzeyinde SARS-CoV-2, influenza A ve solunum sinsityal virusu (RSV) infeksiyon oranlarını anlamak için kullanılmış olan atık su bazlı epidemiyoloji, diğer solunum yolu virusları da dahil olmak üzere toplumda viral solunum yolu infeksiyonu oluşumunu anlamak amacıyla gerçekleştirilmiş. ABD, Kaliforniya'da bulunan büyük bir atık su arıtma tesisinde retrospektif atık su bazlı izlem çalışması gerçekleştirilmiş. Damlacık dijital RT-PCR kullanarak,
1 Şubat 2021 ile 21 Haziran 2022 arasında (216 örnek) 17 ay boyunca haftada üç kez atık sularda influenza A ve influenza B virusları, RSV A ve RSV B, parainfluenza (1-4), rinovirus, mevsimsel koronaviruslar ve metapnömovirusun RNA konsantrasyonları ölçülmüş. İnfluenza dışı viral hedefler için yeni prob tabanlı RT-PCR testleri geliştirilmiş ve doğrulanmış. İki veri kümesi arasındaki uyumu değerlendirmek için California Sentinel Clinical Laboratories (sentinel laboratuvarları)’e gönderilen klinik örneklerden alınan viral infeksiyonlar için viral RNA konsantrasyonları pozitiflik oranlarıyla karşılaştırılmış. En yüksek konsantrasyonlarda insan rinovirusu [medyan konsantrasyon 4300 (0–9500) kopya/gram kuru ağırlık] ve mevsimsel insan koronavirusları [35 000 (17 000–56 000)] bulunmuş. Viral RNA konsantrasyonları, sentinel laboratuvarlarından elde edilen ilişkili viral hastalıkların pozitiflik oranlarıyla önemli ölçüde pozitif korelasyon göstermiş (tau 0.32–0.57, p<0.0009); tek istisna, atık sularda nadiren tespit edilen influenza B ve RSV A imiş. Atık sudan yapılan ölçümler, çalışma süresi boyunca mevsimsel insan koronavirus infeksiyonlarında koronavirus OC43’ün baskın olduğunu, parainfluenza infeksiyonlarında ise parainfluenza 3’ün baskın olduğunu göstermiş. Test edilen tüm viral RNA'ların konsantrasyonları, omikron BA.1 dalgasından sonra belirgin şekilde azalmış ve bu durum, tüm solunum viruslarının dalgalanması ve bulaşması sırasında insan davranışındaki değişiklikler arasında bir bağlantı olduğunu düşündürmüş.
Araştırmacılar elde ettikleri bu sonuçlarla atık su bazlı epidemiyolojinin, birçok kişiyi test etmeye gerek kalmadan yerel, toplum düzeyinde solunum viruslarının dolaşımı hakkında bilgi elde etmek için kullanılabileceğini belirtmişler. Atık sudan elde edilen sonuçların, numune alımından sonraki 24 saat içinde elde edilebileceğine ve bu sayede halk sağlığı müdahaleleri, klinik karar verme ve bireysel davranış değişiklikleri hakkında bilgi vermek için gerçek zamanlı bilgiler üretilebileceğine dikkat çekmişler.
Boehm AB, Hughes B, Duong D, et al. Wastewater concentrations of human influenza, metapneumovirus, parainfluenza, respiratory syncytial virus, rhinovirus, and seasonal coronavirus nucleic-acids during the COVID-19 pandemic: a surveillance study. Lancet Microbe. 2023; 4 (5): e340-e348.
Makale İçin Tıklayınız