Antiretroviral tedavi (ART), HIV-1 replikasyonunu durdurarak viremiyi klinik testlerin saptama sınırının altına düşürür. Bununla birlikte, bazı kişilerde infeksiyöz proviruslar taşıyan CD4+ T hücresi klonlarından kaynaklanan kalıcı, suprese edilemeyen viremi (NSV) görülebilir. Defektif proviruslar, ART sırasında kalıcı olan tüm provirusların %90’ından fazlasını temsil eder ve viral genleri eksprese edebilir, ancak bunların NSV’ye neden olup olmayacağı ve ART yönetimini zorlaştırıp zorlaştırmayacağı bilinmemektedir.
Bu çalışmada tedaviye optimum uyum gösteren ve ilaç direnci olmayan dört çalışma katılımcısında NSV’ye neden olan provirusların derinlemesine bir karakterizasyonu gerçekleştirilmiş. Gözlenen kusurların 5′-ucu RNA özellikleri, virus infektivitesi ve gen ekspresyonu üzerindeki etkisi araştırılmış. Bu provirusları zaman içinde ve hücre alt kümeleri arasında izlemek için entegrasyon bölgesine özgü tahliller kullanılmış.
5′-ucu kusurlu provirusları taşıyan klonların, ~103 51 kopya/mL’ye kadar kalıcı NSV’ye neden olabileceği bulunmuş. Bu proviruslar, ana bağlayıcı donör bölgesini (MSD) içeren küçük, genellikle özdeş delesyon veya nokta mutasyonlarına sahipmiş ve kısmen azalmış RNA dimerizasyonu ve nükleokapsid bağlanması göstermiş. Bununla birlikte, indüklenebilir ve viral RNA içeren ancak zarfı olmayan, bulaşıcı olmayan virionlar üretmişler.
Bu bulgular, CD4+ T hücre klonlarında 5′-ucu defektleri olan provirusların klinik bakımı etkileyerek NSV’ye yol açabileceğini göstermektedir. 5′-ucu sıralaması, viremiyi tamamen bastırmadaki başarısızlığın anlaşılmasına yardımcı olabilir.
White JA, Wu F, Yasin S, et al. Clonally expanded HIV-1 proviruses with 5′-Leader defects can give rise to nonsuppressible residual viremia. J Clin Invest. 2023: e165245.