Araştırmacılar bu çalışmada, R20-14 Pseudomonas aeruginosa izolatından yeni bir KPC-113 varyantını tanımlamışlar. R20-14’ün genomik DNA’sı, Illumina ve Oxford Nanoporebdizilemesine tabi tutulmuş ve plazmidin horizontal geçişi değerlendirilmiş. Bakteri suşlarının minimum inhibe edici konsantrasyonları, sıvı mikrodilüsyon yöntemleri kullanılarak belirlenmiş. Farklı karbapenemaz saptama yöntemlerinin KPC-113 saptanabilirliği test edilmiş ve KPC-113’ün kinetik parametreleri, bir spektrofotometre ile KPC-2’ninkilerle karşılaştırılmış. KPC-2 ve KPC-113’ün yapı modellemesi, Schrödinger kullanılarak yapılmış. Bunların sonucunda sekans tipi 3903 çoklu ilaca dirençli bir suş olan R20-14 suşunun, aynı anda karbapenemlere ve seftazidime-avibaktama (CZA) dirençli olduğu görülmüş. S1 nükleaz
Pulsed-Field Jel Elektroforez ve genomik analiz, daha önce bildirilen tip I KPC-kodlayan P. aeruginosa plazmitlerine benzeyen blaKPC-113 taşıyan plazmit pR20-14 olarak tanımlanmış. KPC-2’de 266 ve 267. pozisyonlarının arasına bir glisin kalıntısı eklenmesiyle KPC-113, DH5a ve PAO1 transformasyonu ile hem karbapenem hem de CZA direnci kazandırmış. KPC-113’ün KPC-2’ye benzer şekilde hareket ettiği gösterilmiş. KPC-2 ile KPC-113 karşılaştırıldığında, KPC-113 karbapenemlere ve seftazidime karşı etkisinin azalmış olduğu, avibaktam inhibisyonuna zayıf yanıt verdiği görülmüş. KPC-113, hem CZA direncine hem de karbapenem direncine aracılık eden yeni bir KPC varyantı olarak tanımlanmış.
Yazarlar KPC-113’ün hem karbapenemleri hem de CZA’yı etkisiz hale getirebilmesini büyük endişe kaynağı olarak değerlendirmişler ve klinik ortamlarda yayılmasını önlemek için büyük çaba sarf edilmesi gerektiğini vurgulamışlar.
Yang Q, Li Y, Fang L, et al. A novel KPC-113 variant conferring carbapenem and ceftazidime-avibactam resistance in a multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa isolate. Clin Microbiol Infect. 2023; 29 (3): 387.e7-387.e14.
