Bu çalışmada üç konunun belirlenmesi amaçlanmış: 1) Bağırsak mikrobiyomunun antimikrobiyal dirençli organizma edinimine karşı kolonizasyon direnci sağlayıp sağlamadığının; 2) Seyahatlerin ve seyahat sırasındaki davranışların bağırsak mikrobiyomu üzerindeki etkisinin; 3) Antimikrobiyal dirençli organizmanın ölçeğinin ve küresel heterojenliğinin.
Bu metagenomik analizde, katılımcıların 8 Aralık 2017 ile 30 Nisan 2019 tarihleri arasında uluslararası seyahatten önce ve sonra evden dışkı örnekleri toplanmış ve üç hedef antimikrobiyal dirençli organizma (genişletilmiş spektrumlu β-laktamaz üreten enterobakterler, karbapenem dirençli enterobakterler ve mcr aracılı kolistine dirençli enterobakterler) açısından taranmak üzere bir klinik mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilmiş. Seyahat öncesi ve seyahat sonrası numuneler, mikrobiyom ve direnç bozukluklarını ve seyahatle ilişkili E.coli suşu edinimini tanımlamak için karşılaştırılmış.
Toplam 267 katılımcıdan oluşan çalışmanın sonucunda, mikrobiyal çeşitliliğin önemli ölçüde tükenmesi ve Enterobacteriaceae familyasının zenginleşmesi ile karakterize edilen bağırsak mikrobiyotasında bir bozulma gözlemlenmiş. Bağırsakta antibiyotiğe dirençli genlerin yaygın şekilde zenginleştiği ve ortalama %15 (%95 CI 10–20, p<1 × 10−10) arttığı gözlemlenmiş. Bu artış, daha önce halk sağlığına yönelik tehdit olarak sınıflandırılan antibiyotiğe dirençli genleri de içeriyormuş; bu genlerin miktarı seyahatten sonra öncesine göre %56 (%95 CI 36–91, p=2 × 10−11) daha fazlaymış. Florokinolona dirençli genler, seyahat öncesi taşıyıcılık tespit edilmeyen 181 yolcunun 97’sinde (%54) gösterilmiş.
Araştırmacılar, arkadaşlarımızı veya akrabalarımızı ziyaret etmenin, Güney Asya’ya seyahat etmenin ve pişmemiş sebze yemenin, hedeflenen üç antimikrobiyal dirençli organizmanın edinilmesi için risk faktörleri olduğunu bulmuşlar. Ancak, seyahat öncesi mikrobiyom yapısı ile seyahatle ilişkili antimikrobiyal dirençli organizma kazanımı arasında bir ilişki gözlemlemediklerini belirtmişler.
Worby CJ, Sridhar S, Turbett SE, et al. Gut microbiome perturbation, antibiotic resistance, and Escherichia coli strain dynamics associated with international travel: a metagenomic analysis Lancet Microbe. 2023; S2666-5247(23)00147-7.